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祁旻正想着找个什么理由跟周晓姗研究员提一下儿,仿佛是心有灵犀一般,微信上立刻就收到了柯栎的消息。
“你的项目怎么样了?还需要我的号么?”
柯栎在微信上问道。
祁旻有些奇怪他突然这么问一句,也没个前言后语,但转念想怕不是他的RNA结构预测算法又出了什么问题,正需要她来“互相帮助”
呢。
“周老师同意我用‘雨云’了。”
祁旻回复道,又接着打字,“你不用跑代码吗?”
这回回应她的是柯栎的语音通话申请。
“怎么了?”
祁旻接起来问道,“RNA结构预测算法出毛病了?”
“唉,你都猜着了。”
柯栎有些不好意思地说,“其实也不是大事儿,就是……我拿公司做深度测序测出来的序列分析,发现了一些奇怪的结果。”
“发给我看看。”
祁旻说道。
柯栎从微信上把他跑出来的一组奇怪结果发给祁旻,祁旻从电脑上打开压缩包,看了一眼这十几条序列,也没瞧出个所以然来。
“这几条怎么了?”
祁旻问道。
“你等会儿,我这儿正在给你发结构预测结果。”
柯栎说道,“行了……你看这几条玩意儿,怎么长得这么奇怪呢?”
祁旻点开他新发的压缩包,打开了其中一条序列对应的预测结果图。
这RNA的确长得够怪,其实有一部分看起来好像还挺规则,但剩下的部分简直像是压根儿无法形成稳定二级结构一样。
“你这是mRNA吧?”
祁旻问道,“你是不是忘了除mRNA了?”
“不会吧……我是用的别人TRIM好的数据。”
柯栎犹豫地说,“怎么除mRNA?”
“你把序列MAP回基因组上,再把MAP到编码区的部分都删掉就行了。”
祁旻说道。
“哦……”
柯栎似懂非懂地答应了一声,又问道,“但我这个应该是已经除过mRNA的数据了,rRNA和tRNA也除过了。”
不是mRNA又应该是有功能的RNA,但是二级结构近乎无定形……祁旻突然想到:“你没去内含子吧?”
真核生物存在RNA的剪切,某些具有功能的RNA在体内是剪切之后才能发挥作用的。
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