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第四章 超算中心（第2页）

祁旻看他这么调真是费劲，于是忍不住说道：“对于最近邻居算法（i，n-i）应该从i大于等于2开始，i是0和1的情况要用氢键最多原理……”

“是‘能量最低’原理。”

调代码的小伙子摘下耳机，转身对她说道，“但是初测值的实验方式不同，这两种算法压根儿不能通用。”

“谁说的？第一对氢键赋值根本不影响。

你先试试吧。”

祁旻对他说道。

小伙子将信将疑地加上了一段儿IF，从另外一个单纯使用能量最低原理的算法里复制出了相关代码。

他再运行之后，输出的矩阵里果然不全是负数了。

但很明显结果也不对。

负数还是太多了，导致最大值才只有不到4，而很明显用于测试的那段30个碱基的线性RNA不可能只形成一个碱基配对。

“这又是怎么回事儿？”

小伙子这回直接对她问道。

祁旻凑到屏幕前仔细看了看，而后一边敲着键盘一边说道：“你这个对比最大值的嵌套FOR语句里没有加FLAG，只要加上就好了……”

代码再运行了一遍，这回输出的矩阵终于看起来正常了。

小伙子松了口气儿，刚要从椅子上站起来，祁旻却说道：“哎，这还是不对。

你看这段RNA的已知结构，这里面有三个LOOP，但你的算法算出来有四个……哦，我知道了，还得加一个防止无效配对的IF，连续两个碱基以下的配对不应该存在。”

她把这个IF语句加进去之后，最终画出的RNA二级结构终于和已知结构一样了。

“呃……你还真……”

小伙子看着屏幕上的图像，不自觉地露出了一丝傻笑。

而后他看了一眼祁旻，有些奇怪地问道：“你是新来的？我记得今年我们这儿不招博士生了——你是技术员？”

“没，我就是来找周晓姗老师有点儿事儿。”

祁旻笑着说道。

“什么事儿？”

小伙子问道，而后像是意识到这个问题有点儿侵犯别人隐私，于是补充道，“或许我也能帮你一下儿。”

“还真没准儿。”

祁旻从他的屏幕面前移开，“我来找周晓姗老师是为了能用一下儿‘雨云’。”

“哦，那好说啊。”

小伙子立刻答应道，“如果我老板不同意，你还能用我的号。”

“这样还是不太好吧……”

祁旻有些尴尬地笑了笑。

跑类脑体占用的计算资源可是非常多的，如果是偷偷用某个博士生的号，肯定会引起管理员的怀疑。

“那有什么的？”

小伙子无所谓地说，“‘雨云’的计算能力这么强，一般的项目根本不是事儿。

老板就是想弄点儿大项目，测试一下儿它的实际计算能力，才召了我们这些个做生物的人来到处接活儿。

说实话，我在来这儿之前都没怎么学过Python。”

看得出来。

祁旻在心里默默地评价了一句，而后又开玩笑地问：“那要是周晓姗老师把我拒了，我可就真来借你的号了？”

“行，当然行。”

小伙子立刻说道，“来加个微信，到时候这个RNA算法出BUG了，我还得再找你呢。”